Нарвался вот на подобную, неприятную ошибку, благо быстро нашел её причину: при создании класса сильно задумался о посторонних вещах и случайно наследовал его от самого себя.
Примерно так:

public class MyClass extends MyClass

“An internal build error has occurred. Right-click for more information.” Сказал непонятно Flex Builder и заглох. Так что будьте бдительный и внимательны господа. Поменьше отвлекайтесь на разную порнуху при написании кода.
И еще пару слов об internal build error. Подобное сообщение можно получить при следующих действиях:

1. Оставить пустой конструкцию switch:

   switch{//ничего не написано}

   .  Решение - удалить или полностью закомментировать  switch.

2. Наследование класса от самого себя. Решение - быть внимательнее
3. При остановки дебаг сессии, но не полной её удалении. Решение - в диспетчере задач убейте процесс adl.exe (их может быть 2) и перебилдите проект.
4. При переименовании существующего  проекта .project или .actionscript могут неправильно обновиться. Решение - пересоздать проект и переместите туда старые файлы, но лучше не переименовывать проекты.
5. Пропущенная точка с запятой на следующей строчке после тега Bindable.

Если ничего не помогло, попробуйте зайти в “журнал ошибок”, не совсем удобно, но может там вы сможете найти место где произошла ошибка.
Help -> About Eclipse SDK -> Configuration Details -> View Error Log.

Информация взята из статьи An internal build error has occurred. Worst error description ever!